音樂噴泉因好電量大、長時間的開啟會使人缺乏新鮮感，且白天開啟噴泉無燈光時效果欠佳，音樂噴泉不可能長時間表演，因此噴泉設計時除考慮作水景的效果，自動控制設計幾個不同的控制方式：
一、程序控制：音樂噴泉也可以設計程序控制，使噴泉水形定時變化；
二、實時聲控：通過任意樂曲控制音樂睡醒的高低起伏，此控制方式適合現場表演事實用；
三、手動控制：平時只開啟某些水形，形成一個固定的組合造型，動態的噴泉配合周邊靜態的廣場、建筑形成水景；
四、預編程控制：將精心選擇的優美經典樂曲所表達的情感與意境，編制各種水形、燈光與音樂巧妙結合，降只能聽到的音樂旋律在視覺形象上得以反映，音樂噴泉效果呈現使人們看到跳動的音符。